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主题词 :

普通田菁转录组茎瘤田菁刺田菁基因组转录组测序

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学科 :

十公里级及以上公里级百米级十米级米级

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所属项目 :

耐盐碱适生作物/植物品种创制

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空间范围 :

时以下时日旬月年十年百年千年

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数据生产方式 :

站点观测实验试验计算模拟遥感解译遥感反演考察调查统计资料数字化加工网络挖掘

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热点云词：土壤有机质

先锋植物基因组数据

为了探索刺田菁的基因组进化和耐盐机制，我们使用PacBio HiFi测序数据（平均读长>15 kb）组装了高耐盐刺田菁SbTA02和盐敏感刺田菁品系SbSA44的高质量基因组。SbTA02和SbSA44基因组的大小分别为1090 Mb和1094 Mb。这些组装分别由10个contig和9个contig构成，SbTA02和SbSA44各自的六对染色体被成功组装。基因组组装显示出高完整性，SbSA44的LTR组装指数为16.7-17.3，碱基质量值为51.8（单碱基准确率99.9993%），SbTA02为55.2（99.9997%）。预测SbTA02和SbSA44分别含有48,835和48,575个蛋白编码基因。我们使用BUSCO评估了基因组的完整性，两者的基因组完整性得分均为99.2%。

2026-01-04

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先锋植物盐胁迫转录组数据

田菁是肥饲兼用的豆科作物，其极强的耐盐碱能力以及饲草品质均与植物茎秆的木质素含量有关。利用二代转录组技术对中科菁6号8个发育时期的茎秆进行测序，来研究田菁耐盐碱性状的机制和饲草收割模式。

2026-01-05

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先锋植物盐胁迫转录组数据

茎瘤田菁材料具有根瘤和特殊的茎瘤器官。利用单细胞转录组扩增技术Smart-seq3，对分选出的茎瘤田菁的茎部瘤和根部瘤的单细胞核扩增、建库和测序，来研究盐碱胁迫下田菁结瘤的发育过程。

2026-01-05

下载量: 2次浏览量: 329次文件量: 3个类型: 其他数据量: 25508

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先锋植物基因组数据

田菁作为一种新型耐盐碱豆科饲草作物，尚未建立高效稳定的遗传转化和基因编辑技术体系。以田菁叶片来源的原生质体作为验证系统，在转染遗传转化载体和基因编辑载体后，结合二代重测序技术评估相关载体的功能效率。

2026-01-04

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先锋植物盐碱胁迫转录组数据

转录组数据示例

2025-12-30

下载量: 0次浏览量: 341次文件量: 3个类型: 表格数据量: 213227.52MB

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